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急性肾小管间质肾炎的发病原因有多种多样的。
首先是感染，临床上儿童在细菌或者病毒感染后，往往可以造成肾小管间质的一些炎症性的改变。
直接的细菌病毒的感染是少数的，多数的原因是免疫复合物形成之后造成的，也就是说它实际上是在肾小管和间质造成了一个免疫复合物的肾炎。这种类型可能是主要的原因，因为在实验过程当中可以发现有肾小管间质的免疫性的IGT或者是C3的沉积，颗粒状的沉积。
第三个原因是过敏性的，过敏性的原因主要是药物引起的，当然还有其他的一些食物，或者是吸入性过敏源。在这其中有一种特发性的急性肾小管间质肾炎，我们称它为TINU。意思就是说，它是一个眼睛和肾脏、肾小管间质肾炎的改变一个综合的眼睛出现葡萄膜炎和肾小管间质肾炎同时存在的一个综合症。这种类型是一个特发性的急性肾小管间质肾炎的一个特殊类型。它的特点主要是有眼睛的葡萄膜炎，包括前葡萄膜炎、全葡萄膜炎还有后葡萄膜炎。在病理损害当中，它可以损伤我们的黄斑、视网膜，造成一些玻璃体的浑浊等等的一些眼睛改变。在临床上可以看到眼睛发红，眼瞳还有肌肉瞳、全身乏力等等这些表现，这是一种特殊类型的急性肾小管间质肾炎。它在间质里边的改变可以出现非干酪样的肉芽肿，同时在骨髓和淋巴结里边也可以出现这种非干酪样的肉芽肿。
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