性传播疾病主要是由于感染相关病原体所致，主要病原体包括病毒、细菌、真菌和寄生虫等。根据不同病原体分类如下：
病毒：艾滋病（由人类免疫缺陷病毒引起）；尖锐湿疣（由人乳头瘤病毒引起）；生殖器疱疹（由单纯疱疹病毒引起）。
细菌：梅毒（由梅毒螺旋体引起）；淋病（由淋病奈瑟菌引起）；沙眼衣原体感染；非淋菌性尿道炎；软下疳（由杜克雷嗜血杆菌引起）；腹股沟肉芽肿（由肉芽肿荚膜杆菌引起）。
真菌：股癣；外阴阴道假丝酵母菌病（由念珠菌属引起）。
寄生虫：阴虱病。